BALAI BESAR LABORATORIUM KESEHATAN MASYARAKAT SURABAYA

VARIAN OMICRON, EPISODE BARU DARI SARS-CoV-2

06 Januari 2022 / By Administrator,

Oleh: dr. Titiek Sulistyowati, M. Ked. Klin, Sp. MK

Sejak 25 November 2021, ada 1 (satu) varian baru yang menjadi kekhawatiran dari dunia yaitu varian OMICRON dan dikategorikan sebagai VoC (Varian of Concern) oleh WHO. Kasus COVID-19 telah dilaporkan pertama kali sejak 23 bulan yang lalu dan perkiraan global telah menunjukkan total 260 juta kasus dan 5,2 juta kematian. OMICRON muncul di tengah situasi KELELAHAN dan FRUSTASI dalam menghadapi pandemik, terutama masalah dampak mental, sosial, dan ekonomi.

Sebelum OMICRON ini, ada beberapa varian yang juga dihadapi oleh dunia antara lain varian ALFA, BETA dan DELTA. Yang terakhir adalah gelombang infeksi oleh varian DELTA yang cukup menggegerkan dunia, termasuk Indonesia. Varian DELTA ini dikaitkan dengan peningkatan viral load (jumlah virus), durasi penularan lebih lama, tingkat reinfeksi atau infeksi berulang lebih tinggi dikarenakan kemampuan menghindar dari kekebalan alami, sehingga mengakibatkan infeksi varian DELTA menjadi dominan dan berkembang cepat secara global.

Kekhawatiran terhadap keampuhan vaksin yang lebih rendah dikarenakan varian baru telah mengubah pemahaman kita tentang permainan akhir COVID-19, mematahkan anggapan dunia bahwa vaksinasi global dengan sendirinya cukup untuk mengendalikan infeksi SARS-CoV-2. VoC telah menyoroti pentingnya kombinasi antara vaksinasi dan tindakan pencegahan kesehatan masyarakat yang ada, seperti masker, sebagai jalur menuju endemisitas virus.

Kasus sekuensing OMICRON pertama kali dilaporkan dari Botswana pada tanggal 11 November 2021, dan beberapa hari kemudian kasus berurutan lainnya dilaporkan dari Hong Kong yaitu seorang turis dari Afrika Selatan. Beberapa rangkaian dari Afrika Selatan menyusul, setelah identifikasi awal bahwa varian baru dikaitkan dengan kegagalan deteksi pada target gen S pada uji PCR spesifik karena adanya delesi pada 69-70del, mirip dengan yang diamati pada varian ALFA. Kasus OMICRON pertama kali dari Afrika Selatan adalah pasien yang didiagnosis dengan COVID-19 pada 9 November 2021, meskipun kemungkinan ada kasus yang tidak teridentifikasi di beberapa negara di dunia sebelumnya. Di Afrika Selatan, jumlah rata-rata 280 kasus COVID-19 per hari dalam seminggu sebelum deteksi OMICRON meningkat menjadi 800 kasus per hari pada minggu berikutnya, sebagian disebabkan oleh peningkatan pengawasan. Kasus COVID-19 meningkat pesat di Afrika Selatan. Kasus OMICRON di Provinsi Gauteng, Afrika Selatan mengalami doubling time lebih tinggi dibandingkan tiga gelombang infeksi sebelumnya.

Kekhawatiran utama tentang OMICRON adalah apakah varian ini lebih menular atau lebih parah daripada VoC lain dan apakah varian ini bisa lolos dari perlindungan vaksin? Meskipun data imunologi dan klinis belum tersedia untuk memberikan bukti pasti, tetapi perkiraan yang diketahui tentang mutasi OMICRON dapat memberikan indikasi awal tentang penularan, keparahan, dan penghindaran dari kekebalan (immune escape). OMICRON memiliki beberapa delesi atau penghapusan dan lebih dari 30 mutasi, beberapa di antaranya adalah 69–70del, T95I, G142D/143–145del, K417N, T478K, N501Y, N655Y, N679K, dan P681H. Mutasi tersebut bersifat tumpang tindih dengan yang ada di varian ALFA, BETA, GAMMA, atau DELTA dan diketahui menyebabkan peningkatan transmisibilitas, afinitas pengikatan virus lebih tinggi, dan lolos dari antibodi juga lebih tinggi. Efek dari sebagian besar mutasi OMICRON yang lain masih belum diketahui, sehingga menghasilkan tingkat ketidakpastian tinggi tentang bagaimana kombinasi penuh dari penghapusan dan mutasi akan mempengaruhi perilaku virus dan kerentanan terhadap kekebalan alami dan yang dimediasi oleh vaksin.

Dampak OMICRON pada transmisibilitas menjadi perhatian. Bukti epidemiologis awal menunjukkan peningkatan kasus di Afrika Selatan dan adanya peningkatan kasus dengan kegagalan deteksi pada target gen S. Meskipun OMICRON kemungkinan besar sangat menular, tetapi masih belum jelas apakah varian ini memiliki transmisibilitas lebih besar daripada DELTA, meskipun indikasi awal menunjukkan bahwa OMICRON menyebar cepat dengan latar belakang transmisi varian DELTA yang sedang berlangsung dan tingkat kekebalan alami yang tinggi terhadap varian DELTA. Jika tren ini berlanjut, OMICRON diperkirakan akan menggusur DELTA sebagai varian dominan di Afrika Selatan. Studi masih terus berlanjut tentang bagaimana VoC baru ini akan mempengaruhi presentasi klinis. Pada tahap ini, data anekdot yang tersedia dari dokter di garis depan Afrika Selatan menunjukkan bahwa pasien dengan OMICRON adalah orang yang lebih muda dengan presentasi klinis yang serupa dengan varian sebelumnya. Meskipun sejauh ini tidak ada kekhawatiran klinis, informasi harus diperlakukan dengan hati-hati mengingat kasus COVID-19 parah biasanya muncul beberapa minggu setelah gejala awal yang terkait dengan penyakit ringan.

Terjemahan dari :

Salim S Abdool Karim, Quarraisha Abdool Karim. 2020. Omicron SARS-CoV-2 variant : a new chapter in the COVID-19 pandemic. The Lancet. Vol 398. Issue 10317. P2126-2128.

Artikel Terbaru

Pernah Merasa Seperti Jatuh Saat Mau Tidur? Kenali Hypnic Jerk

14 September 2026 / By Administrator

Risiko Penyakit Infeksi dan Sistem Surveilan untuk Penanganan Pasca Bencana Gempa Bumi: Penguatan Peran Labkesmas dalam Deteksi Dini dan Respon KLB

31 Agustus 2026 / By Administrator

Mengulas Bacillus cereus: Karakteristik Patogen, Risiko Toksin, dan Manajemen Pencegahan KLB Pangan

30 Juni 2026 / By Administrator

Campak pada Dewasa: Bukan Sekadar Penyakit Anak

16 April 2026 / By Administrator

Selamat Hari Tuberkulosis Sedunia

24 Maret 2026 / By Administrator

Puasa sebagai Intervensi Mikrobiologis : Dampaknya terhadap Kesehatan Usus

27 Februari 2026 / By Administrator

PENGUMUMAN: Pelaksanaan Program Nasional Pemantapan Mutu Eksternal (PNPME) Tahun 2026

07 November 2025 / By Administrator

Menelusuri Jejak Mikroba pada Kasus Keracunan Pangan

30 Oktober 2025 / By Administrator

Sakit Sendi Setelah Demam? Ini yang Perlu Kamu Tahu

22 September 2025 / By Administrator

SI NIMBUS YANG MERESAHKAN

30 Juni 2025 / By Administrator

Hipertensi: Si Pembunuh Senyap yang Sering Diabaikan

10 Juni 2025 / By Administrator

Prinsip Pemenuhan Nutrisi untuk Pasien Tuberkulosis Dalam Rangka Hari TB Dunia

05 Mei 2025 / By Administrator

Bekerja aman di Biosafety Cabinet (BSC)

28 Februari 2025 / By Administrator

Pemeriksaan Kesehatan Gratis (PKG)

10 Januari 2025 / By Administrator

AWaRe

09 Desember 2024 / By Administrator

Budaya Kerja Kemenkes

20 Februari 2024 / By Administrator

Nyamuk Aedes pembawa Wolbachia untuk mencegah infeksi demam berdarah

23 Oktober 2023 / By Administrator

Kondisi medis, gejala, dan penatalaksanaan yang berhubungan dengan panas

06 September 2023 / By Administrator

Menjawab Pertanyaan seputar Penularan Cacar Monyet

08 Agustus 2023 / By Administrator

Yang Harus Diketahui Tentang Antraks

26 Juli 2023 / By Administrator

Listeriosis (Foodborne Disease)

07 Juni 2023 / By Administrator

DETEKSI DNA HPV UNTUK SKRINING KANKER SERVIKS

20 Mei 2023 / By Administrator

Kanker serviks dikarenakan virus HPV

10 April 2023 / By Administrator

Infeksi manusia oleh virus flu burung A(H5)

27 Maret 2023 / By Administrator

Deteksi Infeksi Laten Tuberkulosis (ILTB)

23 Februari 2023 / By Administrator

Patogenesis dan diagnosis Mycobacterium leprae

04 Januari 2023 / By Administrator

SEPUTAR HIV DAN PENCEGAHAN HIV: PROFILAKSIS PASKA PAJANAN

02 Desember 2022 / By Administrator

Resistensi Antimikroba Terkait Perjalanan

09 November 2022 / By Administrator

DETEKSI LABORATORIUM Legionella pneumophilla DARI SPESIMEN MANUSIA

04 Oktober 2022 / By Administrator

LEGIONELLOSIS

02 September 2022 / By Administrator

BAKTERI DALAM AIR SUSU IBU (ASI)

03 Agustus 2022 / By Administrator

DEKONTAMINASI

15 Juli 2022 / By Administrator

PENYAKIT MULUT DAN KUKU PADA HEWAN TERNAK

15 Juni 2022 / By Administrator

PENYAKIT CACAR MONYET (MONKEY POX)

24 Mei 2022 / By Administrator

PENYAKIT HEPATITIS PADA ANAK YANG TIDAK DIKETAHUI PENYEBABNYA

12 April 2022 / By Administrator

WORLD TB DAY 24 Maret 2022 Invest to End TB. Save Lives

23 Maret 2022 / By Administrator

KONDISI PASKA COVID

24 Februari 2022 / By Administrator

VARIAN OMICRON, EPISODE BARU DARI SARS-CoV-2

06 Januari 2022 / By Administrator

DISBARISME

03 Desember 2021 / By Administrator

HIPOKSIA

08 November 2021 / By Administrator

JENIS VAKSIN

12 Oktober 2021 / By Administrator

PRINSIP DASAR VAKSIN

14 September 2021 / By Administrator

KESEHATAN PENERBANGAN

11 Agustus 2021 / By Administrator

PERHATIKAN: PEMAKAIAN MASKER YANG BISA MELINDUNGI DARI COVID-19

20 Juli 2021 / By Administrator

DEMAM DENGUE & DEMAM BERDARAH DENGUE

23 Juni 2021 / By Administrator

PENGUMPULAN SPESIMEN DAHAK YANG BENAR

28 Mei 2021 / By Administrator

VARIAN VIRUS SARS CoV-2

14 April 2021 / By Administrator

VIRUS NIPAH (Niv)

02 Maret 2021 / By Administrator

SEPUTAR FAKTA TENTANG VAKSIN COVID-19

22 Februari 2021 / By Administrator

TRANSMISI VIRUS SARS-CoV-2

19 Januari 2021 / By Administrator

BENARKAH ADA KASUS REINFEKSI COVID-19 ?

08 Desember 2020 / By Administrator

STOP PENYEBARAN “SUPERBUG” GUNAKAN ANTIBIOTIK DENGAN BIJAK

03 November 2020 / By Administrator

IMPACT OF TB LABORATORY DIAGNOSIS IN COVID-19 PANDEMIC

01 September 2020 / By Administrator

Pemeriksaan usap dubur (swab rektal) untuk penjamah makanan

28 Agustus 2020 / By Administrator

DETEKSI BAKTERI RESISTEN

24 Juni 2020 / By Administrator

Penerimaan Karyawan Non PNS Balai Besar Laboratorium Kesehatan Surabaya Tahun 2020

04 Juni 2020 / By Administrator

HERD IMMUNITY

27 Mei 2020 / By Administrator

MENINGITIS BAKTERI

30 April 2020 / By Administrator

HARI TBC SEDUNIA

25 Maret 2020 / By Administrator

PANDEMI COVID-19

17 Maret 2020 / By Administrator

Fakta terbaru : Pneumonia oleh Corona Virus (2019-nCoV)

03 Februari 2020 / By Administrator

Bahaya Tersembunyi Salmonella Enterocolitis Keracunan makanan akibat bakteri Salmonella

09 Desember 2019 / By Administrator

Indonesia Masuki Periode Aging Population

04 Juli 2019 / By Administrator

PENANGANAN PERTAMA DEMAM ANAK

10 Juni 2019 / By Administrator

Hoax Imunisasi Masih Beredar

01 Mei 2019 / By Administrator

WASPADALAH, DIFTERI MASIH ADA !

23 April 2019 / By Administrator

Waspada, Filariasis Ditularkan Melalui Semua Jenis Nyamuk

15 Maret 2019 / By Administrator

Satu Gigitan Anjing Bisa Renggut Nyawa

27 Februari 2019 / By Administrator

Hari Santri 2018: ''Menag Ajak Santri Tebarkan Kedamaian di Sosial Media''

06 September 2018 / By Administrator

Susu Kental Manis Bukan untuk Dikonsumsi Setiap Hari

07 Agustus 2018 / By Administrator

Hari Keluarga Nasional XXV Tahun 2018: Cinta Keluarga, Cinta Terencana

03 Juli 2018 / By Administrator

Kemenkes: Kecanduan Game Adalah Gangguan Perilaku

29 April 2018 / By Administrator

Pemberitahuan PNPME 2018

28 Maret 2018 / By Administrator

Pengumuman Penutupan Pendaftaran PME Kimia Klinik & Mikrobiologi BTA

01 Maret 2018 / By Administrator

VARIAN OMICRON, EPISODE BARU DARI SARS-CoV-2

Artikel Terbaru

TEST